Село Филиппенково сначала, как хутор возникло в начале ХIХ века, в промежутке с 1800 по 1810 годы. Об этом свидетельствует тот факт, что на карте Воронежской губернии за 1797 год село еще значится. В 1815 году здесь проживало уже 450 человек. В 1824 году в Филиппенково была построена Успенская церковь, и поселение стало называться селом. В 1880 году неподалеку от церкви на бугорке было выстроено здание первой школы. Школа была церковно- приходской, было в ней 4 класса. В 1901 году в Филиппенково насчитывалось 251 двор и 1457 жителей.
Во время гражданской войны село являлось местом схваток противоборствующих сторон. В сентябре 1918 года село было захвачено белогвардейцами генерала Краснова. В начале ноября сюда прибыл специальный отряд для проведения мобилизации в белую армию, встретивший противодействие местных граждан.